马来亚大学孔子学院成立于2009年7月8日，由北京外国语大学与马来西亚马来亚大学共同建设，由时任中国教育部副部长郝平、马来西亚教育部副部长何国忠共同揭牌，并于2010年3月起开始正式运营。
马大孔院坐落于马来亚大学主校区，院址占地面积为1470平米，是集办公、咨询、汉语教学、图书阅览、中国文化展示等为一体的多功能场所。马大孔院现有15名公派中文教师，19名汉语教师志愿者，开设了丰富多样的中文课程。
马大孔院以面对马来族等非华裔族群为主要教学对象，同时兼顾华族汉语教学需求。根据北京外国语大学马来语专业优势，注重中马双向语言文化交流机制的建立和发展，为中马友好交流合作搭建平台。马大孔院自建立以来，先后开展的教学活动主要为校内汉语班，基础汉语社会班，汉字书写社会班、中国文化社会班、马大吉兰丹分院汉语课程、与马来西亚国防大学合作的汉语学分课程，马来西亚皇家警察部队培训学校汉语课程，马来西亚外交学院公务员汉语课程，中国武术课程等，2016年，共计有3897名注册学员。
此外，马大孔院立足于马来亚大学的同时，也与当地大学积极合作开设丰富多样的汉语课程，举行多种文化活动，其中包括自2010年起与马来西亚国防大学（UPNM）开设的汉语选修课、在马来亚大学Nilam Puri校区、马来西亚理工大学（USM）、马来西亚工艺大学（UTM）、马来西亚精英大学（HELP Universiti）、马来西亚Politenik社区大学以及森美兰州圣保罗小学（SRK St. Paul Seremban）等院校合作开设基础汉语课程。在教授中文的同时，马大孔院还定期开设太极拳班、围棋班等文化课程，除了中文课程，马大孔院也积极支持本土汉语师资的发展和水平提升，定期举办中文教学研讨会、公开课，关于中国经济文化的研讨会和本土中文教师培训受到了当地中文教师的欢迎和好评。
同时，马大孔院定期举办HSK、YCT考试，吸引了当地中小学及其他中文教学机构学习者的参加。2016年，共有690人参加了HSK考试，182人参加了YCT考试。
除中文教学外，马来亚大学孔院还开展了一系列的文化教育交流活动，如马来西亚教育部汉语教学访华团，大学生短期留学、中小学生北外夏令营、中学生东盟夏令营、“中国文化之夜”大型文化演出、汉语教材书展、马来西亚国立中小学生汉语演讲比赛、“欢庆龙年”活动、“国际语言日”活动、“汉语桥中文比赛”、“东方棋韵”棋类比赛、孔院结业证书颁发仪式、中秋夜、开斋节联谊活动、中国传统饮食文化体验、中国书法比赛、中小学汉语教师培训讲座，以及丰富多彩的班级语言文化活动等，取得了良好的社会反响，马大孔院日益受到马来西亚社会各界的普遍关注。
在未来发展中，马大孔院将继续根据当地多元文化社会的特点合理规划设计课程、开展各项工作，进一步扩大汉语教学范围，开设更多更具针对性的汉语课程种类，与马来西亚政府部门、当地大学、中小学及当地企业谋求进一步的合作，继续开展HSK考试项目，开展本土中文教师培训，开展更多针对性强、社会普遍关注的文化交流活动等。
